Sau ngày miền Nam hoàn toàn giải phóng, Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh chủ trương thành lập một bệnh viện đa khoa đầu ngành là Bệnh viện Điện Biên Phủ, bao gồm 3 chuyên khoa: Tai Mũi Họng, Mắt, Răng Hàm Mặt.
12/05/1986 Ủy Ban Nhân Dân Thành phố Hồ Chí Minh ra quyết định số 60/QĐ-UB của Ủy Ban Nhân Dân thành lập Trung tâm Tai Mũi Họng – tiền thân của Bệnh viện Tai Mũi Họng TP. Hồ Chí Minh
Sau một thời gian chuẩn bị, Trung tâm Tai Mũi Họng đã chính thức ra mắt và chọn ngày này là ngày kỷ niệm thành lập.
19/12/1986 Trung tâm Tai Mũi Họng được hình thành trên cơ sở tách cán bộ từ Khoa Tai Mũi Họng của Bệnh viện Điện Biên Phủ; về cơ cở vật chất lấy từ phòng khám cán bộ sơ trung cấp Bệnh viện Nguyễn Trãi.
Trung tâm được mở rộng thêm mặt bằng trên cơ sở Công ty Xăng Dầu Khu vực II, xây dựng khu B mở rộng phòng khám bệnh và 03 phòng mổ.
Năm 2002 xây dựng khu C bao gồm khu Kỹ thuật cao, phòng mổ, hội trường.
26/08/2002 Ủy Ban Nhân Dân Thành phố Hồ Chí Minh ra Quyết định số 3497/QĐ-UB đổi tên Trung tâm Tai Mũi Họng thành Bệnh viện Tai Mũi Họng, trực thuộc Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh.
Bệnh viện được mở rộng thêm khu D (157B Trần Quốc Thảo) để bố trí khu khám bệnh ngoại trú và phẫu thuật về trong ngày.
Tạm sử tầng trệt căn hộ 157 Trần Quốc Thảo, phường 9, quận 3 (đang chờ dự án) để triển khai khu khám và điều trị Bảo hiểm Y tế.
16/07/2008 Ủy Ban Nhân Dân Thành phố Hồ Chí Minh ra quyết định số 3054/QĐ-UB về việc xếp Hạng I cho Bệnh viện Tai Mũi Họng trực thuộc Sở Y tế Thành Phố Hồ Chí Minh.